最近的北山湖里鱼类繁殖非常异常，为了查明原因科特队展开了行动。居住在北山湖旁的妖怪博士对恐龙有着很深的研究，但性格古怪的他对媒体采访非常排斥。湖中出现的怪兽吉拉斯正是妖怪博士所饲养的，他也正是失踪依旧的二阶堂教授，对恐龙的执念让他变得疯狂，前来制止吉拉斯的正是宇宙英雄奥特曼。