经历战斗后的众人已经遍体鳞伤，但他们却没有停留的时间，他们现在要尽快与库洛斯元帅汇合。闭关锁国将近300年的日本现在已经成为了千年伯爵的巢穴，在这里不管是人类还是AKUMA只有强者才能生存下去，他们来到了一个危险的国度。诺亚一族在诺亚方舟内聚集，千年伯爵有了新的打算，为了迎接即将到来的破灭之命运，他们要换乘拥有新资格的方舟。