找回遗失的原子弹是科特队现在的首要任务，根据沉默的巡视艇船员称这颗原子弹被挂在了巨大的怪兽身上，经调查这次的怪兽是日本海中的海底猿人拉贡，由于受到辐射的缘故变异成了身高30米的怪物。携带着原子弹的拉贡让科特队无法展开攻击，而再次阻止灾难发生的正是正义的伙伴奥特曼。