在一百年后的未来毕什普依旧存在，改变了思维的他缔造了现在的世界，通过监控他看到了来自一百年前的忍者神龟们，为了和平他再次找上门来。从毕什普口中忍者神龟们得知近期名为Torbin Ziixx的惯犯会有所行动，忍者神龟们追踪之后才知道他运送去月球的包裹竟然是个炸弹，而这一切都是Sh’okanabo打算摧毁地球防御网的阴谋。