小智等人与曾经在某个森林认识的短裤少年阿奇重逢。阿奇自从上次跟小智告别后，也到橙华道馆挑战过，现在正在这个森林修行，小智等人决定陪阿奇修行一阵子。可是在战斗中，阿奇的猫鼬斩的样子却有些异常。原来它是察觉到了藏在树丛中的宿敌，火箭队的饭匙蛇的气息，两只神奇宝贝立刻开始了一场死斗。