在莎莉娜的提议下大家一起去拜访布拉塔诺博士，就在大伙开开心心吃马卡龙时，火箭队突然闯入并抓走博士。在他们的威胁下，博士交出了让神奇宝贝超进化的资料...
在神奇宝贝中心时，由于莉姆的大意，把装着皮丘的背包和柚丽嘉装着咚咚鼠的背包弄混了。看见柚丽嘉的皮丘吓得使出绝招，莎莉娜保护了柚丽嘉，皮卡丘也用十万...
正在前往下一个道馆所在地遥香市的小智一行人，遇到了神秘的少年忍者和呱头蛙。面对拥有呱头蛙小精灵的少年忍者三平，小智对三平提出了对战的请求，于是小智...
来到古木镇的小智一行人，一进入城门就听到了一阵奇怪的噪音。在一番了解之后，小智等人得知原来是因为今年卡比兽未被唤醒而一直沉睡。为了唤醒时不时发出噪...
就在火箭队一众讨论如何抓皮卡丘的时候，神秘的X女士出现在火箭队的面前。为了得到皮卡丘，X女士控制了火箭队的武藏与小次郎，躲过一劫的喵喵提醒小智一行人...
能在战斗中获得爵位的战斗城堡引起了小智等人的兴趣，在说唱兄弟尼古拉和特斯拉的带领下，小智等人来到了战斗城堡。不同于道馆战，战斗城堡的战斗充满了骑士...
在最近流行的神奇宝贝录像里，第一名是偶像神奇宝贝组合出道的艾露和火狐狸，莎莉娜不甘示弱，也准备拍摄神奇宝贝录像出道。一番努力后莎莉娜的录像终于拍好...
小智一行人途经古香水族馆，在那里他们不光看见了来自各地的水系神奇宝贝，还看到了黄金的鲤鱼王雕像。他们在海边看到了正在垂钓的馆长和铁臂枪虾，听说了黄...
前往遥香道馆的小智等人遇到了三色堇，而三色堇这次采访的目的地“古香镇化石研究所”引起了小智等人的兴趣。大家来到化石研究所的大冰库，遇到了喜欢亲近人的...
为了得到第二枚徽章，小智一行人终于到达了遥香市，向查克洛先生提出道馆战的小智将要展现自己的特训成果。登上绝壁的小智得到了查克洛的认可，特训后的呱呱...