对战金字塔的战斗采用的是四比四的淘汰赛。小智因为神代巧妙地运用大绝招与小绝招而陷入苦战，但他还是以与生俱来的毅力跟神奇宝贝们的默契，把比赛拉到平手的局面。最后双方都只剩下一只神奇宝贝，此时神代派上场的是传说中的神奇宝贝雷吉艾斯。小智派出皮卡丘来挑战雷吉艾斯，可是…