小智等人前往浅红市途径一座森林，由于山崩的关系，道路无法通行。小智等人只好改变行进的方向，此时皮卡丘不知为何突然跑进森林深处。就在小智等人不知该如何是好时，遇到前来森林进行任务的神奇宝贝保育家日向。小智等人听说森林发生异变，赶忙与日向一起进入森林深处追回皮卡丘，在森林里他们了发现伤痕累累的雪拉比。