前往帆巴市的小智一行人，在途中遇到神奇宝贝抚养家波比与三只粗鲁神奇宝贝单首龙。这 三只单首龙是第一次被托付给抚养家照顾，所以想逃走去找训练家。为了帮助没有照顾过龙系神奇宝贝的波比，来自龙之乡的艾莉丝主动说要帮忙，小智他们也决定从旁协助。一群人便立刻开始照顾神奇宝贝，可是其中一只单首龙特别怕生，大家要怎么做才能让单首龙打起精神呢？