为了前往雪花市，小智一行人决定穿越罗斯山的洞窟，但是却在途中迷路了。循着远方敲打声前进的他们，遇见捧着大块岩石非常兴奋的藤夫。身为业余考古学者的藤夫，长年累月不断研究，终于挖到古代龟神奇宝贝原盖海龟的化石。据说原盖海龟很久以前就已经灭绝，可是藤夫却说他在孩提时代曾与活着的原盖海龟玩耍。