小智在希特隆和柚丽嘉的带领下，在神奇宝贝中心登记参加卡洛斯地方联盟，并决定前往白檀市挑战道馆训练家紫罗兰。希特隆、柚莉嘉、小智三人在路上遇上了咚咚鼠，柚丽嘉决定收养咚咚鼠，但忽然出现的小箭雀抢走咚咚鼠的食物，使得咚咚鼠哭着逃走了。小智的呱呱泡蛙因为无法忍受小箭雀的野蛮而主动攻击，但它无法对抗在天空飞翔的小箭雀，小箭雀极快的速度也让小智决定收服它。