小智抱着衰弱的呱呱泡蛙来到布拉塔诺博士的研究所，在苏菲的治疗下，呱呱泡蛙逐渐恢复健康，布拉塔诺博士也将呱呱泡蛙过去不断逃离训练家的经过告诉小智。博士带小智、希特隆和柚丽嘉参观研究所，还谈到了超进化的可能性，他的烈咬陆鲨就是他的研究对象。此时窃听到超进化讯息的火箭队准备行动了……